VMware
Valitse virtuaalikoneiden listasta virtuaalikone, jonka haluat poistaa ja paina sen kohdalla hiiren oikeanpuoleista nappia (tai paina control-klick). VMware Workstationissa valitse "Remove", VMware Playerissä "Delete VM from Disk" tai VMware Fusionissa "Delete". Virtuaalikonetta ei voi poistaa sen ollessa käynnissä, vaan se on ensin sammutettava.
VirtualBox
Virtuaalikoneen saa poistettua VirtualBoxista valitsemalla ylävalikosta Machine → Remove kuvan osoittamalla tavalla:
VirtualBox kysyy, haluatko poistaa koneen vain VirtualBoxin konelistauksesta vai myös varsinaisen virtuaalikonetiedoston. Tämä koskee VirtualBoxin hakemistossa olevaa konetiedostoa, eikä vaikuta ova-tiedostoon, josta virtuaalikone on alun perin tuotu.